大象传媒

Den tradisjonelle prosessen for design og oppdagelse av legemidler inneb忙rer at man syntetiserer og tester tusenvis av forbindelser i laboratoriet (in vitro). Fra dette store utvalget identifiserer forskerne noen f氓 lovende kandidater som testes videre i realistiske og relevante modeller, fra celler til organoider og dyr. Det er imidlertid kostbart og sv忙rt tidkrevende 氓 syntetisere og teste et s氓 stort antall forbindelser. Dette er en av grunnene til at det i dag kan ta 10-15 氓r og koste milliarder av dollar 氓 fullf酶re en vellykket legemiddeloppdagelseskampanje. For 氓 redusere b氓de tids- og pengebruken i en utviklingen av nye legemidler har det blitt foresl氓tt metoder basert p氓 datasimuleringer. Disse metodene, som kalles 鈥渁lkymistiske beregninger av fri energi鈥�, er basert p氓 statistisk termodynamikk og Newtons mekanikk, og har i ettertid vist seg 氓 v忙re tiln忙rmet eksperimentelt n酶yaktighet.

I denne avhandlingen har vi utforsket bruken av en alkymistisk metode for beregning av fri energi, kalt 鈥渕ultisite 位-dynamikk (螠S位D)鈥�, i kombinasjon med eksperimentelle metoder i et prosjekt om aktiv legemiddelutforming. Forskningen v氓r var rettet mot to enzymer som spiller en n酶kkelrolle i kronisk betennelse i lungene, noe som kan f酶re til sykdommer som astma, bronkiektasi og emfysem. Resultatene v氓re viser at MS位D kan forutsi bindingsaffiniteten til potensielle legemiddelkandidater med stor n酶yaktighet, slik at vi effektivt kan identifisere de mest lovende forbindelsene. I tillegg har vi i dette prosjektet ogs氓 designet nye medikamentlignende molekyler rettet mot disse enzymene. Noen av forbindelsene v氓re kan fungere som doble hemmere, noe som betyr at ett og samme molekyl kan blokkere aktiviteten til begge enzymene samtidig.

Konklusjonen er at en kombinasjon av alkymistiske metoder for beregning av fri energi og laboratorieeksperimenter kan ha en positiv innvirkning p氓 suksessraten for legemiddelutvikling og fremskynde prosessen med 氓 f氓 nye legemidler ut p氓 markedet.

Personalia

Parveen Gartan (f. 1995) fullf酶rte bachelorgrad og mastergrad i kjemi i India ved hhv. University of Delhi (New Delhi), og Indian Institute of Technology Jodhpur. Han utf酶rte sitt doktorgradsarbeid ved Kjemisk institutt og Computational Biology Unit med professor Nathalie Reuter som hovedveileder og professor Charles L. Brooks III (University of Michigan, Ann Arbor, USA) som biveileder.