´óÏó´«Ã½

Home
Department of Informatics

Warning message

There has not been added a translated version of this content. You can either try searching or go to the "area" home page to see if you can find the information there
Forskerportrett

Eivind Valen forsker på data i celler

Eivind Valen er professor i bioinformatikk, og jobber med å forstå kroppen gjennom bruk av biologiske stordata.

Professor Eivind Valen
Professor Eivind Valen jobber med å forstå DNA og RNA.
Photo:
Randi H Eilertsen, UiB

Main content

- Jeg er bioinformatiker, så det jeg gjør går mer på å svare på biologiske spørsmål enn å utvikle de kuleste algoritmene. Vi anser oss som biologer som bruker litt andre verktøy enn eksperimentelle biologer – mer statistikk, matematikk og maskinlæring – for å få mening ut av biologiske data, forklarer Eivind Valen.

Det var ikke en selvfølge at han skulle ende opp i akkurat dette feltet.

- Opprinnelig er jeg informatiker, og trives egentlig med det. Men da jeg jobbet i industrien ved siden av studiene innså jeg at jeg ikke var interessert i å utvikle applikasjoner for andre. Jeg begynte derfor å kikke på hvilke andre ting man kan bruke informatikk til, sier Eivind.

I 2004 hadde kjæresten til Eivind flyttet til København, så han begynte å kikke på hvilke studiemuligheter som fantes der.

-ÌýÌý ÌýBioinformatikk var det som var nytt og «hot» pÃ¥ den tiden, sÃ¥ da gav jeg det forsøk. Etter hvert tok jeg ogsÃ¥ biologikurs, sÃ¥nn at jeg kunne skjønne litt mer av hva jeg holdt pÃ¥ med.

Selv om valget var noe tilfeldig, ble Eivind etter hvert mer opptatt av de biologiske spørsmålene. Etter å ha gjort ferdig doktorgraden sin på Universitetet i København reiste han videre til Harvard og Broad Institute hvor han jobbet som postdoc.

Eivind leder nå Valen-gruppen på Computational Biology Unit, hvor de prøver å løse mysterier rundt genregulering.

Alle cellene i kroppen har det samme arvematerialet, men de ser forskjellige ut og gjør forskjellige ting. Dette er på grunn av genregulering: Hvordan bestemmer en celle seg hva den skal gjøre? Hvordan avgjør den hvor mye som skal produseres av et gitt protein i en gitt kontekst?

Uvanlig celleaktivitet kan være grunnlaget for sykdom, men slike avvik er ikke enkle å oppdage. Denne oppgaven mener Eivind er perfekt for informatikk.

-ÌýÌý ÌýDet er blitt mye enklere Ã¥ samle store mengder data om hva som foregÃ¥r i cellene, men det betyr ikke at det er blitt enkelt Ã¥ fÃ¥ mening ut av dem. Det er akkurat der informatikk og biologi kan fÃ¥ til sÃ¥ mye bra sammen, mener Eivind.

-ÌýÌý ÌýInformatikk kan bidra til Ã¥ prosessere, visualisere og forstÃ¥ de biologiske dataene. PÃ¥ lang sikt er mÃ¥let Ã¥ kunne modellere alt som foregÃ¥r i cellene, slik at vi kan fÃ¥ en helhetlig forstÃ¥else av hva som skjer i kroppen.

Ìý